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Etwa

Ich bin ein Bioinformatiker, der sich auf Genomtechnologien, Echtzeit-Nanoporensequenzierung, Signalanalyse, maschinelles Lernen und zugehörige Hardware spezialisiert hat. Ich habe einen Hintergrund in der Softwareentwicklung und mehr als ein Jahrzehnt Erfahrung in der Pathologiebranche.
 

Als Leiter der computergestützten Entwicklung innerhalb der Genomic Technologies Group des Center for Population Genomics am Garvan Institute of Medical Research setze ich meine einzigartigen Fähigkeiten ein, um neue bioinformatische Werkzeuge zu entwickeln sowie die Infrastruktur für die Nanoporensequenzierung zu entwerfen und zu unterstützen.

Meine Forschungsgebiete umfassen:

  • Nanoporen-Signalanalyse

  • Klinische Prüfung und Methodenentwicklung

  • Kurze Tandemwiederholungsstörungen

  • Virale Genomik (HIV/SARS-Cov-2)

  • Einzelzellsequenzierung

  • Direkte RNA-Sequenzierung

  • Genom-Assemblierung

  • Methylierungserkennung

  • Maschinelles/tiefes Lernen

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Erfahrung

Garvan Institute / Analyst für genomische Systeme

Juni 2017 - HEUTE,  Darlinghurst

Cerebro Biosystems / Mitbegründer und CTO

Oktober 2017 - HEUTE,  Darlinghurst

Healius (Grundversorgung) / Leitender Softwareentwickler 

Dezember 2017 - HEUTE,  St. Leonards

Garvan Institute / Forschungsassistent

Dezember 2016 - Juni 2017,  Darlinghurst

Primary Healthcare / Analyst Programmierer

Juni 2015 - Juni 2017,  St. Leonards

Douglas Hanly Moir Pathologie / Laborassistent

2011 - 2015,  Macquarie-Park

Davies Campbell De Lambert/Healthscope Pathologie/Laborassistent

2009-2011,  Ryde

Auszeichnungen

  • 2020 – Zweitplatzierter Posterpreis – London Calling

  • 2019 - Lichtgesprächspreis - ABACBS/GIW

  • 2018 - Palmer-Innovationspreis - Garvan-Preis

  • 2017 - J&J-Auszeichnung - Med Tech's Got Talent

  • 2017 – Garvan Award: Für die Unterstützung der Bioinformatik-Kultur bei Garvan

  • 2017 – Late Breaking Poster Award – AGTA-Konferenz

Fähigkeiten

  • Linux/UNIX, BASH

  • Python, statistische Programmierung in R, C, AHK, SQL

  • Algorithmus-Design

  • Hochleistungsrechnen (SGE)

  • Bioinformatik, Data Science

  • Systemadministration, Automatisierung, Vernetzung,\

  • Laborinformationssysteme (LIS)

Kontakt
Information

Gruppe Genomische Technologien
Zentrum für Populationsgenomik

Garvan Institute of Medical Research

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